תהליך הסניטציה מתבצע מידי שנה לקראת סופו של האביב, בתקופה בה מסתיימים רוב הגידולים בערבה, המטופחים דווקא בחורף- כאשר ברוב השווקים בעולם, אין מספיק ירקות, ולכן קיים יתרון יחסי כלכלי גבוה לחקלאי הערבה.
בתהליך הסניטציה מנקים לחלוטין חקלאי הערבה ואף עוקרים את הגידולים החקלאיים העונתיים בחממות הגידול- גידולי שדה, עשבי בר וכדומה, לרבות הגינות הביתיות וכן חממות המחקר שבמו"פ (מחקר ופיתוח) ערבה תיכונה וצפונית. כמו כן בתקופה זו מטפלים באופן ממוקד בעשבייה במטעים, שכן העשבייה עשויה להעביר מחלות ומזיקים לגידולים.
מדובר בתהליך הכולל בשלב ראשון עקירה של הגידולים מהקרקע, לאחר מכן פיזור של קומפוסט על הערוגות והפעלת מערך ההשקיה. השלב השלישי 'תיחוח'- במהלכו מבצעים ריסוק של הקרקע העליונה, ערבוב והחדרת הקומפוסט לאדמה ויישור הערוגה באמצעות כלי מכני- 'מתחחת אדמה'. בשלב האחרון נפרשים צינורות השקיה והקרקע מכוסה באמצעות פלטות פלסטיק, לשם חיטוי סולארי כשבפועל מערך ההשקיה שומר על קרקע לחה המתחממת באופן משמעותי לעבר ה 60-70 מעלות , בשל קרינת השמש ולוחות הפלסטיק. החום מאפשר את השלמת תהליך הסניטציה, הורג את המזיקים ומעניק טיפול למחלות השונות, וכך נשמרת הקרקע נקייה לחלוטין, ומוכנה לקראת עונת השתילה הבאה בחורף. "המטרה הינה להגיע לרמת סניטציה גבוהה, באמצעות הפעולות בשטחים החקלאיים ובכך לאפשר גידולים חקלאיים איכותיים במיוחד וללא מזיקים לקראת עונת הגידולים הבאה" ציינו בוועדה החקלאית בערבה תיכונה.
ראש המועצה האזורית ערבה תיכונה אייל בלום אומר: "בערבה התיכונה קיים תכנון, ניהול ופיתוח חקלאי בר קיימא המתייחס לחקלאות כמערכת רב תפקודית, המכירה בתועלות הסביבתיות. תפיסת הקיימות מאזנת בין דרכי השימור וההגנה על המשאב הטבעי והסביבה, לבין גידולי חקלאות ופיתוח חקלאות. כחלק מהמדיניות הזו, אנו גוזרים על עצמנו בערבה, תהליך סניטציה גורפת, לשם ביעור הנגעים והמזיקים- תהליך ייחודי לערבה ונובע מהסטנדרטים הגבוהים שמנחים את חקלאי הערבה". עוד מוסיף בלום כי בערבה התיכונה נשמר ניקיון מוקפד לאורך כל השנה באזורים החקלאיים ובתוך הישובים. כל חריגה פוגעת בגידולים החקלאיים בחממות הנשמרות סטריליות בכדי להימנע ממזיקים. "בפעילות החקלאית נוצרים תוצרי לוואי המוגדרים כפסולת העלולה להפוך ממשאב כלכלי, למטרד סביבתי. אנו פועלים כמו במדינות המתדמות בעולם- הפרדה במקור, תהליך קומפוסטציה ומחזור, על מנת להטיב עם הסביבה ולשמור על גידולים חקלאיים נקיים ממחלות ובאיכות הגבוהה" הוסיף בלום
בנוסף, יישובי המועצה האזורית הערבה התיכונה, היו הראשונים להשתמש בפחי מחזור יעודים לרבות אזור מרכזי בו יוצרים קומפוסט להחזרת הפסולת האורגנית לאדמה. המודעות למחזור ושמירה על הקרקע החקלאית, מתחילים כבר במערכת החינוך.
